2001年7月16日，中俄两国在北京签订了《中俄睦邻友好合作条约》，标志着中俄战略合作伙伴关系的建立。为具体落实合作条约，两国政府又于2004年10月14日签订了《中俄睦邻友好合作条约实施纲要》，《纲要》的签订进一步深化了民间的交流活动。

2005年7月，胡锦涛总书记在访俄期间，与普京总统共同宣布决定2006年在中国举办“俄罗斯年”、2007年在俄罗斯举办“中国年”的活动。中俄青少年运动会是互办国家交流年众多活动中唯一一项体育活动。第一届和第二届中俄青少年运动会分别于2006和2007年在中国天津和俄罗斯莫斯科举办，2008年因北京奥运会未举办。双方商定，作为中俄人文合作机制项目，2008年奥运会后继续在两国轮流举办中俄青少年运动会。

2009年7月第三届中俄青少年运动会在北京举办。2011年7月第四届中俄青少年运动会在俄罗斯奔萨举行。（双方原计划2010年在俄罗斯举办第四届中俄青少年运动会。后由于2010年有新加坡青奥会、广州亚运会等多项赛事，双方经过多次协商，商定第四届中俄青少年运动会2011年7月4-9日在俄罗斯奔萨举办。）2013年第五届在上海举行，2015年第六届在俄罗斯伊尔库茨克举行。

举办中俄青少年运动会，是中俄两国战略协作伙伴关系在体育领域的体现,对于增进两国青少年之间的理解交流和两国关系的发展将起到积极的推动作用,同时也是锻炼和培养我国竞技体育后备人才的良好时机。

2017年第七届中俄青少年运动会在中国广州隆重举行，由国家体育总局主办，广东省体育局承办。其中女子水球项目于11月5、6日在广东省奥林匹克体育中心游泳跳水馆举行！